CASP7 CM_easy Best-Z_score scores

last update: 2006-10-24

WARNING: column sorting gets messed up in some browsers (e.g. firefox), especially the negative values in the Z-scores

WARNING: these tables for informational purposes only. do not use them as a means of assessing exact performance in CASP7, as they suffer from all of the problems inherent to automatic evaluation. they are not to be trusted! for other inherently flawed automatic evaluations see Zhang, CAFASP/Fischer (by domains is better), SBC/Wallner&Elofsson, Offman, McGuffin, Soding, and BioInfo/Rychlewski (the "contact" measure offers the most different scoring approach).

if you have any questions or comments, feel free to contact me at DCChivian-at-lbl.gov

get the native PDB codes
get the renumbered native PDB coordinates
get my (rough) definition and classification of the domains

CM_easy   BLAST-level homolog available   First   Score from First model only
CM_hard   PSI-BLAST-level homolog available   Best   Score from Best scoring model (up to 5)
FR_H   Remote homolog detectable with strong confidence (by 3D-Jury)   GDT_MM   GDT using MAMMOTH MaxSub at 1, 2, 3, 4, and 7 Angstroms
FR_A-NF   No homolog detectable with strong confidence (by 3D-Jury)   Z_score   Z-score derived from GDT_MM for that target

CM_easy: [First-GDT_MM] [First-Z_score] [Best-GDT_MM] [Best-Z_score]
CM_hard: [First-GDT_MM] [First-Z_score] [Best-GDT_MM] [Best-Z_score]
FR_H: [First-GDT_MM] [First-Z_score] [Best-GDT_MM] [Best-Z_score]
FR_A-NF: [First-GDT_MM] [First-Z_score] [Best-GDT_MM] [Best-Z_score]
GROUP SUM 288 290 291_1 291_2 292_1 292_2 294_1 294_2 295_1 295_2 297 302 303_1 303_2 305 308 310_1 310_2 310_3 313 315 317 318_2 323_1 323_2 324_1 324_2 326 328 329_1 329_2 332 339_1 339_2 340 341_1 341_2 345 346 359 362 366 371_1 371_2 376 378_1 378_2 379_1 379_2 380 381_1 381_2 384_1 SUM GROUP
3D-JIGSAW 4.52 -0.10 0.28 0.59 0.52 0.20 -0.21 0.51 0.43 0.34 0.42 0.07 0.29 -0.08 -1.06 0.15 -0.23 0.36 0.53 0.64 0.44 0.12 0.17 0.20 -0.17 0.38 0.08 0.59 -2.11 -1.38 -0.24 0.19 0.31 0.33 0.31 0.06 0.41 0.41 0.12 0.28 0.05 -0.21 0.38 0.02 0.32 -0.04 0.30 -0.11 0.59 -0.59 0.49 -0.13 -0.67 4.52 3D-JIGSAW
3D-JIGSAW_POPULUS 1.18 -0.43 0.28 0.59 0.19 0.14 -0.13 0.57 0.44 0.31 0.49 0.17 -0.05 -0.56 0.29 0.16 -0.39 0.40 0.50 0.76 0.55 0.09 0.29 0.22 -0.34 0.23 0.06 0.63 -2.11 -1.38 -0.17 0.40 0.28 0.18 0.30 0.12 -0.01 0.43 0.12 0.29 0.05 0.04 0.28 0.08 0.19 -0.10 -3.64 0.44 0.03 0.76 -0.35 0.22 -0.09 -0.63 1.18 3D-JIGSAW_POPULUS
3D-JIGSAW_RECOM 1.96 0.08 0.27 0.60 0.28 0.14 -0.18 0.50 0.42 0.34 0.43 0.08 -0.27 -0.49 0.41 0.17 -0.28 0.36 0.53 0.64 0.53 0.23 0.27 0.23 -0.25 0.39 0.04 0.44 -2.11 -1.38 -0.98 0.11 0.46 0.16 0.28 0.13 -0.26 0.40 0.12 0.27 0.04 -0.06 0.13 0.09 0.17 -0.08 0.51 0.08 -0.73 -0.75 0.22 -0.12 -0.65 1.96 3D-JIGSAW_RECOM
3Dpro 21.10 0.50 0.38 0.27 0.44 0.28 0.21 0.73 0.45 0.46 0.46 -0.05 0.27 0.56 0.70 0.42 -0.13 0.50 0.14 0.20 0.52 0.60 0.66 0.41 0.89 0.64 0.77 0.63 0.52 0.72 0.44 -1.44 0.47 0.74 0.47 0.42 0.30 0.52 0.45 0.36 0.46 0.56 0.43 0.46 0.34 -0.13 0.75 0.72 0.30 0.43 0.44 0.33 0.06 0.07 21.10 3Dpro
ABIpro -161.68 -3.64 -3.55 -2.79 -3.32 -3.36 -3.71 -2.83 -3.62 -3.48 -2.07 -3.53 -3.67 -3.20 -1.32 -4.03 -3.21 -3.60 -3.15 -3.25 -3.83 -3.90 -3.41 -3.65 -2.07 -2.63 -3.57 -2.09 -2.09 -1.25 -3.35 -1.40 -5.10 -3.06 -3.68 -3.67 -4.03 -3.03 -3.27 -4.10 -3.42 -3.41 -4.46 -2.69 -2.25 -2.52 -3.05 -2.52 -0.26 -2.69 -3.25 -3.98 -2.72 -161.68 ABIpro
BayesHH 13.59 -0.23 0.34 -0.65 0.10 0.24 0.20 0.44 -0.35 0.40 0.52 0.31 0.14 0.49 0.24 0.41 0.72 0.40 0.62 -0.63 0.00 0.61 -1.64 0.55 -0.05 0.52 -0.00 0.03 0.48 0.89 0.53 0.43 0.25 0.59 0.01 0.29 0.67 0.27 0.43 0.27 0.33 0.39 0.26 0.63 -0.39 0.59 0.42 0.60 0.33 -1.06 0.75 0.57 0.60 0.71 13.59 BayesHH
beautshot 11.97 0.18 0.30 0.43 0.42 0.03 0.44 0.13 0.34 0.16 0.38 0.36 0.41 0.50 0.46 0.31 0.03 -0.47 -0.94 -0.67 0.36 0.29 0.51 0.21 -0.93 -0.10 0.43 0.31 0.05 0.28 0.43 0.09 0.33 0.40 0.33 0.10 0.59 0.07 0.22 0.27 0.33 0.16 0.09 0.55 0.51 0.54 0.17 0.21 0.57 -0.21 0.65 0.42 0.41 0.54 11.97 beautshot
beautshotbase 12.84 0.11 0.31 0.55 0.44 0.14 0.29 0.48 0.55 0.35 0.50 0.47 0.27 0.38 0.28 0.19 -0.14 -0.65 -1.20 -0.80 0.31 0.27 0.28 0.26 0.14 0.30 0.22 0.05 0.63 0.86 0.29 0.47 0.24 0.13 0.43 0.28 0.44 0.04 0.37 0.29 0.33 0.06 0.09 0.37 0.45 0.03 0.12 0.04 0.40 0.45 0.48 0.49 0.31 0.42 12.84 beautshotbase
Bilab-ENABLE 17.03 0.34 0.37 0.69 0.47 0.45 0.41 0.53 0.08 0.42 0.51 0.50 0.16 0.43 0.17 0.22 0.50 0.48 0.36 0.78 0.49 0.15 0.28 0.18 0.43 0.20 0.39 0.03 0.58 -0.75 0.27 0.64 -0.80 0.66 0.52 -0.13 0.26 0.12 0.43 0.28 0.35 0.45 0.42 0.34 0.57 0.21 0.59 0.08 0.33 0.59 0.79 -0.43 0.09 0.55 17.03 Bilab-ENABLE
CaspIta-FOX 16.57 0.46 0.31 0.67 0.55 0.32 0.12 0.51 0.46 0.36 0.46 0.26 0.07 0.39 0.09 0.30 0.69 0.62 0.77 0.59 0.45 0.25 -0.22 0.38 0.25 0.37 0.17 0.27 0.51 -1.29 -0.02 0.13 0.20 0.24 0.23 0.29 0.43 0.36 0.41 0.31 0.39 0.30 0.06 0.42 0.51 0.32 0.21 0.25 0.37 0.47 0.58 0.52 0.14 0.31 16.57 CaspIta-FOX
CIRCLE 24.03 0.26 0.37 0.71 0.46 0.36 0.39 0.42 0.52 0.42 0.57 -0.01 0.25 0.51 0.44 0.32 -0.32 0.65 0.60 0.76 0.48 0.29 0.47 0.30 0.82 0.15 0.49 0.50 0.60 0.85 0.44 0.89 0.28 0.66 0.57 0.29 0.34 0.40 0.42 0.36 0.13 0.54 0.30 0.52 0.59 0.49 0.59 0.63 0.23 0.64 0.71 0.57 0.33 0.52 24.03 CIRCLE
CPHmodels -7.97 0.37 0.50 -0.52 -0.60 -0.60 -3.97 0.18 -0.30 0.27 0.26 0.61 -0.37 0.22 0.04 -0.23 -0.56 0.16 -0.91 0.33 0.42 0.38 -0.72 -1.42 0.19 -0.64 0.43 -0.12 0.17 0.25 0.37 0.22 -0.50 -0.22 0.33 -0.38 -0.51 -0.87 -0.50 -0.01 -0.46 0.66 -0.21 0.49 0.26 -0.48 -7.97 CPHmodels
Distill -57.61 0.11 -0.64 -0.28 -0.37 -0.53 -0.36 -1.26 -0.73 -0.61 -1.71 -1.59 -1.26 -1.06 -0.85 -1.25 -0.01 -1.15 -2.02 -0.79 -0.69 -0.44 -0.88 -0.79 -2.56 -2.63 -1.47 -2.00 -1.95 -1.15 -1.11 -1.98 -0.92 -1.52 -1.95 -0.37 -1.57 -0.96 -0.32 -0.78 -0.03 -1.14 -0.37 -2.18 -1.18 -2.16 -1.32 -0.30 -1.20 0.52 -1.51 -2.75 -0.82 -0.74 -57.61 Distill
FAMS 25.12 0.24 0.33 0.63 0.46 0.36 0.39 0.42 0.52 0.42 0.53 0.11 0.25 0.46 0.44 0.42 -0.21 0.65 0.62 0.73 0.48 0.34 0.53 0.32 0.82 0.19 0.40 0.44 0.60 0.85 0.44 0.89 0.29 0.66 0.57 0.29 0.42 0.40 0.40 0.36 0.44 0.54 0.36 0.52 0.61 0.57 0.69 0.61 0.42 0.64 0.70 0.55 0.53 0.47 25.12 FAMS
FAMSD 21.83 0.26 0.38 0.71 0.46 0.20 0.15 0.41 0.39 0.42 0.50 0.32 0.22 0.51 0.44 0.33 -0.22 0.65 0.60 0.73 0.27 0.35 0.44 0.36 0.38 0.24 0.42 0.07 0.61 0.83 0.56 0.89 0.29 0.50 0.57 0.28 0.53 0.40 0.41 0.30 -0.16 0.31 0.26 0.46 0.44 0.28 0.12 0.70 0.41 0.73 0.72 0.55 0.37 0.47 21.83 FAMSD
FOLDpro 21.47 0.34 0.29 0.20 0.42 0.34 0.23 0.64 0.48 0.46 0.46 0.54 0.31 0.43 0.72 0.40 0.87 0.19 0.26 -0.26 0.58 0.57 0.57 0.40 0.58 0.39 0.86 0.44 0.55 0.74 0.55 -0.91 0.65 0.73 0.52 0.40 0.32 0.51 0.45 0.28 0.44 0.23 0.43 0.73 0.34 0.03 0.74 0.66 0.30 0.36 0.31 0.33 0.06 0.03 21.47 FOLDpro
forecast-s -16.11 0.32 -0.03 -0.25 0.08 0.07 0.37 -3.04 -2.27 -0.62 -1.39 0.38 0.34 0.12 0.28 0.27 -0.78 -0.04 0.43 0.73 0.35 0.22 0.29 0.14 -1.07 -0.06 -1.12 -3.26 -0.90 -1.32 0.32 0.26 0.17 0.07 0.35 -0.47 -1.89 -0.50 0.40 -0.14 0.13 0.09 -0.01 -1.33 0.12 -0.25 0.15 0.24 0.50 -0.45 -0.34 -0.05 -1.71 -16.11 forecast-s
FORTE1 -17.29 0.11 -0.04 -0.22 0.04 0.39 0.17 0.30 0.25 -2.13 -2.32 -0.06 0.34 0.11 -0.67 0.22 -0.20 -0.16 -0.84 0.37 0.39 0.22 -0.32 0.34 -0.84 0.12 0.14 0.07 0.31 -1.32 -0.45 -0.74 0.12 0.23 -0.27 0.29 -1.79 -2.48 -1.09 -0.14 0.37 0.43 -0.56 -1.87 -2.03 -0.01 0.20 0.38 -0.48 -1.79 -0.13 -0.50 0.00 0.23 -17.29 FORTE1
FORTE2 -20.05 0.11 -0.04 -0.34 0.04 0.34 0.17 0.30 0.25 -2.13 -2.26 -0.58 0.34 0.11 -0.67 0.20 -0.20 -0.01 0.29 0.31 -0.01 0.24 -0.32 0.34 -0.84 -0.11 0.14 0.07 0.31 -1.32 -0.42 -0.79 0.16 0.08 -0.98 0.29 -1.79 -2.86 -2.47 -0.14 0.37 0.43 -0.56 -1.53 -2.03 0.03 0.20 0.38 -0.48 -2.26 -0.13 -0.50 0.00 0.23 -20.05 FORTE2
FPSOLVER-SERVER -204.80 -4.63 -4.26 -3.12 -4.03 -4.57 -4.45 -3.51 -3.70 -3.89 -2.98 -3.77 -4.60 -3.61 -2.73 -4.22 -4.10 -4.32 -3.23 -3.51 -3.95 -4.37 -4.36 -3.63 -3.15 -4.43 -4.39 -2.77 -2.17 -1.34 -4.04 -2.70 -5.22 -4.20 -4.08 -5.27 -4.62 -4.08 -3.65 -4.54 -4.39 -4.32 -5.78 -3.05 -2.71 -4.92 -3.54 -3.77 -4.06 -2.73 -2.99 -4.28 -4.69 -3.38 -204.80 FPSOLVER-SERVER
Frankenstein -11.29 0.69 0.10 0.18 0.31 0.53 0.53 -2.00 -3.45 -2.20 -1.03 0.26 -0.49 0.21 0.36 0.20 0.28 -1.60 -2.69 -0.37 0.53 0.20 -0.77 -2.21 0.68 -0.40 0.35 0.53 -11.29 Frankenstein
FUGMOD 13.04 0.35 0.36 -0.71 -0.66 0.34 0.34 0.22 0.42 0.26 0.50 0.46 0.35 0.35 0.18 0.17 0.45 0.50 0.10 0.68 0.28 0.42 0.37 1.00 0.30 0.44 0.29 0.52 0.68 0.41 0.51 0.34 0.28 0.37 -0.15 -0.46 -0.12 0.32 0.33 0.26 0.44 0.38 -0.16 0.09 0.37 0.36 0.54 0.17 -0.47 0.01 0.27 13.04 FUGMOD
FUGUE 8.13 0.19 0.36 -0.80 -0.06 0.36 0.33 0.11 0.34 0.33 0.33 0.35 0.34 0.25 0.07 0.06 0.38 0.34 0.55 0.73 0.29 0.23 0.32 0.33 1.08 0.09 0.19 0.44 0.51 -0.72 0.35 0.19 -0.20 0.06 0.37 -0.31 -0.70 -0.29 0.31 0.25 0.09 0.27 0.23 -0.28 -0.02 0.19 0.08 0.03 0.26 0.47 -0.34 -0.50 -0.03 0.32 8.13 FUGUE
FUNCTION 18.77 0.24 0.21 0.69 0.50 0.18 -0.08 0.49 0.57 0.40 0.47 0.35 0.11 0.42 0.24 0.34 -0.31 0.36 0.70 0.50 0.24 0.28 0.47 0.35 -0.17 0.37 0.41 -0.01 0.59 0.82 0.41 0.62 0.34 0.66 0.46 0.26 0.43 0.49 0.40 0.28 0.37 0.27 0.36 0.44 0.59 0.57 0.38 0.02 0.27 0.47 -0.39 0.55 0.41 0.39 18.77 FUNCTION
GeneSilicoMetaServer 22.33 0.42 0.37 0.35 0.58 0.39 0.43 0.48 0.34 0.39 0.45 0.44 0.45 0.43 0.46 0.35 0.92 0.44 0.77 -0.64 0.44 0.32 0.43 0.41 0.96 0.31 0.34 0.18 0.61 0.91 0.33 0.45 0.40 0.42 0.37 0.22 0.56 0.43 0.28 0.47 0.37 0.38 0.45 0.57 0.25 0.72 0.15 0.36 0.85 0.36 0.47 0.35 0.37 22.33 GeneSilicoMetaServer
gtg -8.90 -0.40 0.26 0.58 0.33 0.51 0.19 0.26 0.31 0.37 -0.87 0.22 0.14 -0.17 -0.54 0.28 -0.79 0.23 0.96 -0.64 -0.47 -0.39 -0.21 -0.36 0.20 -2.42 -1.58 0.09 -0.06 -2.20 -0.53 0.22 0.18 -0.65 -2.22 0.25 -8.90 gtg
HHpred1 13.43 0.25 0.28 0.61 0.48 0.45 0.28 0.35 0.33 0.38 0.48 0.20 0.48 0.42 0.09 0.25 -0.30 0.43 0.70 -0.64 -0.41 0.02 0.36 0.31 -0.16 0.27 0.36 0.09 0.57 0.90 0.41 0.40 0.35 0.51 -0.06 0.34 0.24 0.25 0.28 0.36 0.33 0.51 -0.73 0.31 -0.60 0.38 0.86 0.04 0.30 0.54 0.53 -0.37 -0.03 0.44 13.43 HHpred1
HHpred2 13.24 -0.26 0.28 -0.77 0.10 0.11 0.31 0.44 -0.34 0.39 0.57 0.27 0.22 0.47 0.52 0.40 0.71 0.43 0.70 -0.64 -0.01 0.55 -1.64 0.50 -0.17 0.35 0.07 -0.10 0.48 0.90 0.48 0.55 0.25 0.57 0.07 0.34 0.61 0.09 0.27 0.24 0.49 0.51 0.55 0.66 0.29 0.41 0.57 0.52 0.38 -2.09 0.79 0.63 0.57 0.67 13.24 HHpred2
HHpred3 13.21 -0.26 0.28 -0.77 0.10 0.11 0.31 0.44 -0.34 0.39 0.57 0.30 0.22 0.47 0.52 0.43 0.73 0.48 0.89 -0.64 -0.01 0.60 -1.64 0.41 -0.17 0.35 -0.05 0.14 0.48 0.90 0.60 0.49