SSGCID - BrmaA.20601.a Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha Domain 1 Parse 1 Confidence: 0.53

Job IDStatusMethodUsernameTargetLengthDate (PST)Expiration Date (PST)
106674CompleteStructure prediction ssgcidSSGCID - BrmaA.20601.a Vo...18863 Aug 2021-
Domain IDDomainParseConfidence Modeling MethodModel SpanLengthDate (PST)
99780110.53comparative modeling1-188618864 Aug 2021
             1   .   10    .   20    .   30    .   40    .   50    .   60    .   70    .   80    .   90    .  100    .  110    .  120    .  130    .  140    .  150    .  160    .  170    .  180    .  190    .  200    .  210    .  220    .  230    .  240    .  250    .  260    .  270    .  280    .  290    .  300    .  310    .  320    .  330    .  340    .  350    .  360    .  370    .  380    .  390    .  400    .  410    .  420    .  430    .  440    .  450    .  460    .  470    .  480    .  490    .  500    .  510    .  520    .  530    .  540    .  550    .  560    .  570    .  580    .  590    .  600    .  610    .  620    .  630    .  640    .  650    .  660    .  670    .  680    .  690    .  700    .  710    .  720    .  730    .  740    .  750    .  760    .  770    .  780    .  790    .  800    .  810    .  820    .  830    .  840    .  850    .  860    .  870    .  880    .  890    .  900    .  910    .  920    .  930    .  940    .  950    .  960    .  970    .  980    .  990    . 1000    . 1010    . 1020    . 1030    . 1040    . 1050    . 1060    . 1070    . 1080    . 1090    . 1100    . 1110    . 1120    . 1130    . 1140    . 1150    . 1160    . 1170    . 1180    . 1190    . 1200    . 1210    . 1220    . 1230    . 1240    . 1250    . 1260    . 1270    . 1280    . 1290    . 1300    . 1310    . 1320    . 1330    . 1340    . 1350    . 1360    . 1370    . 1380    . 1390    . 1400    . 1410    . 1420    . 1430    . 1440    . 1450    . 1460    . 1470    . 1480    . 1490    . 1500    . 1510    . 1520    . 1530    . 1540    . 1550    . 1560    . 1570    . 1580    . 1590    . 1600    . 1610    . 1620    . 1630    . 1640    . 1650    . 1660    . 1670    . 1680    . 1690    . 1700    . 1710    . 1720    . 1730    . 1740    . 1750    . 1760    . 1770    . 1780    . 1790    . 1800    . 1810    . 1820    . 1830    . 1840    . 1850    . 1860    . 1870    . 1880    . 
   sequence: MSVLVSMMASSTEEDDHHAEDPHKSDLWQQTLQAAVAATSQSEAAKKRQQQRKPMRQNNVVERSERSLLCLTLSNPLRKACITIVEWRPFEWLILLMICANCIALAVYQPYPAQDSDTKNIILEQIEYLFIVVFTIECVLKVIALGFLFHPGAYLRNAWNILDFIIVVIGLVSTALSRMNIQGFDVKALRAFRVLRPLRLVSGVPSLQVVLNAILRAMIPLLHIALLVMFVIIIYAIIGLELFCGKLHSTCFDPTTGELAQHTPSTCGFASSAFHCQPNGHYEGVHWVCTSNTSWQGPNNGITNFDNFGLAMLTVFQCVSLEGWTDVMYWVNDAVGREWPWIYFVTLVILGSFFVLNLVLGVLSGEFSKEREKARARGLFQKFREKQQLEEDLKGYLDWINQAEDIEPVNDDEQEDEQQFNGEELDEETDEKTDDSRPSWWKKRLRRMQKLNRRCRRGCRRLVKSQTFYWLVIVLVLLNTLVLTTEHYKQEPWLDHFQTVANLFFVILFSMEMILKMYSLGLTTYTTSQFNRFDCFVVISSIVEFVLVYFDLMKPLGVSVLRSARLLRIFKVTKYWTSLRNLVSSLLNSLRSIMSLLLLLFLFIVIFALLGMQVFGGKFNFNPMNPKPRANFDTFIQALLTVFQILTGEDWNTVMYNGIASFGGVGSWGVLVSVYFIVLFICGNYILLNVFLAIAVDNLADADSLTNAEKEEEQAEVEEEVAEDDYEDEKYDENGNEETRDDSRIVMEEEEEGGEIITARPRRMSELVTAKQQKPIPKASSLFILSHTNPFRVFCNKIVNHSYFTNSVLICILVSSAMLAAEDPLEAQSPRNTILNYFDYFFTTVFTVEITLKVVVYGLMFHKGSFCRNAFNLLDILVVAVSLVSFVLKSDAISVVKILRVLRVLRPLRAINRAKGLKHVVQCVIVAVKTIGNIMLVTFMLQFMFAIIGVQLFKGTFFRCTDESKMTEYECRGEFLAYEDGDPMKPLRMRREWIKNDFNFDNVGDAMISLFVVSTFEGWPDLLYVAINSNEEDHGPVYNARQAVAIFFITFIVVIAFFMMNIFVGFVIVTFQNEGEREYENCELDKNQRKCIEFALKAKPHRRYIPRNRFQYRVWWFVTSQFFEYVIFIIILLNTTTLAMKHYPPDPGMDHVLDVLNLIFTGVFALEAVFKIIALNPKNYFGDRWNAFDFVIVLGSFIDIIYGKLSPGSNIISINFFRLFRVMRLVKLLSRGEGIRTLLWTFMKSFQALPYVALLIVLLFFIYAVIGMQVFGKVALNDETHIHRNNNFHTFPAAVLVLFRSATGEAWQEIMLSCSDRDEVKCDPASDDYKQNPDAKCGVDFAYPYFISFFMLCSFLVINLFVAVIMDNFDYLTRDWSILGPHHLEEFVRLWSEYDPDAKGRIKHLDVVTLLRKISPPLGFGKLCPHRLACKRLVSMNMPLNSDGTVCFNATLFALVRTNLKIYTEGNIDEVNEQLRSAIRRIWKRTPQKMLDEVVPPAGRDDDVTVGKFYATFLIQDYFRRFKKRKELESKGIVPQQTSQAMALQAGLRTLHEIGPELKRAISGNLETDFTLDVEEPQHRRPHSLFNNIISALGGSARANQIYREDRTTRSLSMTANNQLSPTRSLYGNNDMVSVTAHGHLTSNCSINIPPSARSNGGVLQRRLPQIPSPNISFNQKLLENDLLVSRLALNAESHYILANRSMPLDTDEEEEWGERRDTNRLRNDETWMNNGRPGKGLRKPFMLARNQAMAIAGVPADISEAFEGTYRPAPDGKSVRLPLSNRPVLRPDRNEEGLTGRLVGEALALGRYMDERVVEAARREIAEAYSLEESELESAAATLADARYMEHLGMERCEVRDFNRYSARALLRPAPSQEAPEDDLFITTL
 deepconcnf: ---E-----------------------------------HHHHHHHHHHH----------------EEEEE----HHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------------------------------------------------------HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHH--------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHH-------EEEEHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------------HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHH--------------------------------------------HHHHH----------EEEEE----HHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EE--------------EEEEEE------------EE------HHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------------HHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHH----------------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------------HHHHHHHHHHH------------HHHHHHH-----------HHHHHHHHHHH----------EEEHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHH------H--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHH---------------------HHHHHHHHH----------------------------------------------------------------------------------HHH--HHHHHHHH------EEEEE---------HHHHHHHH---------HHHH-----------HHHHHHHHHHHHH-------------EEE-----EEE-----------------HHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHH--HHHHHH----------HHHH------------------EEEEE-
    psipred: --HHHHHHH------------------HHHHHHHH----HHHHHHHHHH-----------------EEEEE----HHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHH-----EEEEEEEEEEHHHHHHH--------EEHHHHHH---HHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHH-------------------------------------------------------HHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHH-----EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----------HH---------------HHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHH------EEEEEEEHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---EE---------------HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHH--------EEEEEEEEEEEEE-HHHHHHHHHHHHH--HH-HHH--HHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHH--------------------------------HHH-------------EEEEE----HHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH------HH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----EEEEEHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----EEE-------HHHH--EEEEE--------------EE------HHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHH---------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHH-------------EEEEEEEE----HHHHHHHHHHHHHHHHHH------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------EEEEEEEEHHEEEEE-------EEEEEHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--EE----------------HHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHH--------------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHH------------HHHHHHHHHH---------EEEEEEEHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHH-----HHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHH--HHHHH-HHHHHHH----HHHHH--------------HHHHHHHHH--------------------------------------------------------------------------------HH------------------EEEEE---------HHHHHHH--------------------------HHHHHHHH-----------------EEE-----EEE-----------------HHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHH---HHHHHHH---HHHHHHHHHH-HHH-------------EEEEE--
    spider3: -------------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------------------HHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHEE----------------------E-----------EE----------------HHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHH--------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------------------HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHH---------------HHHH-------------HHHHH----------HHHHH------HHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-H----------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----EE--------HHHH---EEEE---------E---EE---------HHHHHHHHHHHHH---HHHHHHHHHH-------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHH------HHHHHHHHHHHH------------HHHHHHHHH--HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH--HHH---HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-----------------HHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHHHH-------------------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH-HHHH---HH---HHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHH-----------HHHHHHHHHHH----------EEEHHHHHHHHHHH--------HHHHHHHHHHHHHHHH----HHHHHH------------HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH---------HHHHHHHHHHHHHHH-HHHHHHHH---------------------HHHHHHHHH------------------------------------------------------------------------------------------------------EEEE---------HHHHH---------------------------HHHHHHHHHHHH--------------EE------EEE-----------------HHHHHHHHHHHH-----HHHHHHHHHHHHHHHH--HHHHHHHHHHH--HHHHHH----HHHHH-HHH-------------------EEEE--
| | View
Powered by 3Dmol.js


Alignment cluster 1 [ RosettaCM constraints ]

Powered by MSAViewer



Baker Lab | Rosetta@home | Contact | Terms of Service
©2022 University of Washington