User input for job 704254

Modeling method AB only

Sequence

AVEKIGNRFDLVLVAARRARQMQVGGKDPLVPEENDKTTVIALREIEEGLINNQILDVRERQEQQEQEA

Constraints

AtomPair CA 1 CA 4 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 2 CA 5 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 3 CA 6 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 4 CA 7 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 5 CA 8 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 6 CA 9 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 7 CA 10 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 8 CA 11 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 8 CA 12 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 9 CA 12 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 9 CA 13 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 10 CA 6 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 10 CA 13 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 10 CA 14 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 11 CA 7 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 11 CA 14 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 11 CA 15 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 12 CA 15 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 12 CA 16 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 13 CA 16 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 13 CA 17 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 14 CA 17 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 14 CA 18 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 15 CA 18 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 15 CA 19 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 16 CA 19 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 16 CA 20 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 17 CA 20 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 17 CA 21 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 18 CA 21 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 18 CA 22 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 19 CA 22 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 19 CA 23 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 20 CA 23 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 20 CA 24 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 21 CA 24 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 21 CA 25 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 22 CA 25 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 22 CA 26 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 23 CA 26 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 24 CA 27 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 25 CA 28 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 26 CA 29 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 27 CA 23 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 27 CA 30 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 28 CA 24 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 28 CA 31 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 28 CA 32 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 29 CA 32 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 30 CA 33 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 31 CA 34 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 32 CA 35 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 32 CA 36 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 33 CA 36 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 33 CA 37 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 34 CA 37 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 34 CA 38 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 35 CA 38 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 35 CA 39 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 36 CA 39 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 36 CA 40 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 37 CA 40 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 37 CA 41 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 38 CA 41 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 38 CA 42 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 39 CA 42 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 39 CA 43 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 40 CA 43 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 40 CA 44 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 41 CA 44 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 41 CA 45 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 42 CA 45 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 42 CA 46 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 43 CA 46 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 43 CA 47 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 44 CA 47 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 44 CA 48 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 45 CA 48 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 45 CA 49 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 46 CA 49 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 46 CA 50 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 47 CA 50 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 47 CA 51 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 48 CA 51 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 48 CA 52 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 49 CA 52 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 50 CA 45 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 50 CA 53 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 51 CA 54 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 51 CA 55 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 52 CA 55 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 52 CA 56 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 53 CA 49 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 53 CA 56 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 53 CA 57 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 54 CA 50 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 54 CA 57 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 54 CA 58 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 55 CA 50 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 55 CA 58 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 55 CA 59 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 56 CA 59 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 56 CA 60 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 57 CA 60 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 57 CA 61 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 58 CA 61 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 58 CA 62 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 59 CA 54 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 59 CA 62 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 59 CA 63 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 60 CA 63 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 60 CA 64 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 61 CA 64 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 61 CA 65 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 62 CA 65 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 62 CA 66 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 63 CA 66 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 64 CA 67 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 65 CA 68 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 67 CA 63 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500

Forced secondary structure in fragment libraries

   1 A C  1.000  0.000  0.000
   2 V C  1.000  0.000  0.000
   3 E C  1.000  0.000  0.000
   4 K C  1.000  0.000  0.000
   5 I C  1.000  0.000  0.000
   6 G C  1.000  0.000  0.000
   7 N C  1.000  0.000  0.000
   8 R C  1.000  0.000  0.000
   9 F C  1.000  0.000  0.000
  10 D H  0.000  1.000  0.000
  11 L H  0.000  1.000  0.000
  12 V H  0.000  1.000  0.000
  13 L H  0.000  1.000  0.000
  14 V H  0.000  1.000  0.000
  15 A H  0.000  1.000  0.000
  16 A H  0.000  1.000  0.000
  17 R H  0.000  1.000  0.000
  18 R H  0.000  1.000  0.000
  19 A H  0.000  1.000  0.000
  20 R H  0.000  1.000  0.000
  21 Q H  0.000  1.000  0.000
  22 M H  0.000  1.000  0.000
  23 Q H  0.000  1.000  0.000
  24 V C  1.000  0.000  0.000
  25 G C  1.000  0.000  0.000
  26 G C  1.000  0.000  0.000
  27 K C  1.000  0.000  0.000
  28 D C  1.000  0.000  0.000
  29 P C  1.000  0.000  0.000
  30 L C  1.000  0.000  0.000
  31 V C  1.000  0.000  0.000
  32 P C  1.000  0.000  0.000
  33 E C  1.000  0.000  0.000
  34 E C  1.000  0.000  0.000
  35 N C  1.000  0.000  0.000
  36 D C  1.000  0.000  0.000
  37 K C  1.000  0.000  0.000
  38 T H  0.000  1.000  0.000
  39 T H  0.000  1.000  0.000
  40 V H  0.000  1.000  0.000
  41 I H  0.000  1.000  0.000
  42 A H  0.000  1.000  0.000
  43 L H  0.000  1.000  0.000
  44 R H  0.000  1.000  0.000
  45 E H  0.000  1.000  0.000
  46 I H  0.000  1.000  0.000
  47 E H  0.000  1.000  0.000
  48 E C  1.000  0.000  0.000
  49 G C  1.000  0.000  0.000
  50 L C  1.000  0.000  0.000
  51 I C  1.000  0.000  0.000
  52 N C  1.000  0.000  0.000
  53 N H  0.000  1.000  0.000
  54 Q H  0.000  1.000  0.000
  55 I H  0.000  1.000  0.000
  56 L H  0.000  1.000  0.000
  57 D H  0.000  1.000  0.000
  58 V H  0.000  1.000  0.000
  59 R H  0.000  1.000  0.000
  60 E H  0.000  1.000  0.000
  61 R H  0.000  1.000  0.000
  62 Q H  0.000  1.000  0.000
  63 E H  0.000  1.000  0.000
  64 Q H  0.000  1.000  0.000
  65 Q H  0.000  1.000  0.000
  66 E H  0.000  1.000  0.000
  67 Q H  0.000  1.000  0.000
  68 E H  0.000  1.000  0.000
  69 A C  1.000  0.000  0.000

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