User input for job 704289

Modeling method AB only

Sequence

AVVTGAAKRIGRAIAVKLHQTGYRVVIHYHNSAEAAVSLADELNKERSNTAVVCQAD

Constraints

AtomPair CA 2 CA 5 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 4 CA 7 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 5 CA 8 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 6 CA 3 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 7 CA 10 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 8 CA 11 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 8 CA 12 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 9 CA 6 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 9 CA 12 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 9 CA 13 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 10 CA 13 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 10 CA 14 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 11 CA 14 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 12 CA 15 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 13 CA 16 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 14 CA 17 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 15 CA 18 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 16 CA 19 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 16 CA 20 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 17 CA 20 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 17 CA 21 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 18 CA 14 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 18 CA 21 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 18 CA 22 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 19 CA 22 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 23 CA 20 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 27 CA 24 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 27 CA 30 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 28 CA 31 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 29 CA 32 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 29 CA 33 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 30 CA 33 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 31 CA 34 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 32 CA 35 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 33 CA 36 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 33 CA 37 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 34 CA 30 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 34 CA 37 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 34 CA 38 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 35 CA 38 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 35 CA 39 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 36 CA 39 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 36 CA 40 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 37 CA 40 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 37 CA 41 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 38 CA 41 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 38 CA 42 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 39 CA 42 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 39 CA 43 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 40 CA 43 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 40 CA 44 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 41 CA 44 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 42 CA 45 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 43 CA 46 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 44 CA 47 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 45 CA 48 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 46 CA 49 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 47 CA 50 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 48 CA 51 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 49 CA 52 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 50 CA 53 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 50 CA 54 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 51 CA 54 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 51 CA 55 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 52 CA 55 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 52 CA 56 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 53 CA 56 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 53 CA 57 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500 AtomPair CA 54 CA 57 SUMFUNC 2 SIGMOID 5.500 2.500 CONSTANTFUNC -0.500

Forced secondary structure in fragment libraries

   1 A C  1.000  0.000  0.000
   2 V E  0.000  0.000  1.000
   3 V E  0.000  0.000  1.000
   4 T C  1.000  0.000  0.000
   5 G C  1.000  0.000  0.000
   6 A C  1.000  0.000  0.000
   7 A C  1.000  0.000  0.000
   8 K C  1.000  0.000  0.000
   9 R H  0.000  1.000  0.000
  10 I H  0.000  1.000  0.000
  11 G H  0.000  1.000  0.000
  12 R H  0.000  1.000  0.000
  13 A H  0.000  1.000  0.000
  14 I H  0.000  1.000  0.000
  15 A H  0.000  1.000  0.000
  16 V H  0.000  1.000  0.000
  17 K H  0.000  1.000  0.000
  18 L H  0.000  1.000  0.000
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  20 Q H  0.000  1.000  0.000
  21 T H  0.000  1.000  0.000
  22 G C  1.000  0.000  0.000
  23 Y C  1.000  0.000  0.000
  24 R C  1.000  0.000  0.000
  25 V E  0.000  0.000  1.000
  26 V E  0.000  0.000  1.000
  27 I E  0.000  0.000  1.000
  28 H E  0.000  0.000  1.000
  29 Y E  0.000  0.000  1.000
  30 H C  1.000  0.000  0.000
  31 N C  1.000  0.000  0.000
  32 S C  1.000  0.000  0.000
  33 A H  0.000  1.000  0.000
  34 E H  0.000  1.000  0.000
  35 A H  0.000  1.000  0.000
  36 A H  0.000  1.000  0.000
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  38 S H  0.000  1.000  0.000
  39 L H  0.000  1.000  0.000
  40 A H  0.000  1.000  0.000
  41 D H  0.000  1.000  0.000
  42 E H  0.000  1.000  0.000
  43 L H  0.000  1.000  0.000
  44 N H  0.000  1.000  0.000
  45 K H  0.000  1.000  0.000
  46 E H  0.000  1.000  0.000
  47 R C  1.000  0.000  0.000
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  49 N C  1.000  0.000  0.000
  50 T C  1.000  0.000  0.000
  51 A E  0.000  0.000  1.000
  52 V E  0.000  0.000  1.000
  53 V E  0.000  0.000  1.000
  54 C E  0.000  0.000  1.000
  55 Q E  0.000  0.000  1.000
  56 A C  1.000  0.000  0.000
  57 D C  1.000  0.000  0.000

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